دستور نيوز
عمان – في ظل انتشار البكتيريا المقاومة للمضادات الحيوية، كان لا بد من البحث عن آلية جديدة لانتشارها في المستشفيات، حيث قد تكون بعض الأنواع أكثر انتشاراً في منطقة من أخرى، وإعطاء الدواء المناسب لتوفير الجهد والوقت والمساعدة في شفاء المرضى. إن معرفة تسلسل جميع البكتيريا في العينة يعطي صورة أكثر اكتمالاً عن التنوع الموجود في منطقة ما، وهو أمر بالغ الأهمية للتنبؤ بالمخاطر وفهم العوامل الخارجية المشاركة في انتشار سلالة معينة. “إعلان إضافي لدى العلماء في الغرب باحثون مكلفون بإعداد دراسات حول الأمراض وغيرها، بينما هنا لا يوجد متخصصون، ويبقى الأمر مهمة فردية وقد لا يتم تشجيعها أو تخصيصها. طور فريق بحثي دولي تقنية جينومية جديدة يمكنها تتبع انتشار العديد من الجراثيم الخارقة في مستشفى في وقت واحد. طبق العلماء في معهد ويلكوم سانجر وجامعة أوسلو ومؤسسة IRCCS Policlinico San Matteo والمتعاونون نهجًا جديدًا للتسلسل العميق لجميع مسببات الأمراض لالتقاط جميع البكتيريا المعدية الشائعة في المستشفى، في وقت واحد. تعتمد الأساليب الحالية على زراعة وتسلسل جميع مسببات الأمراض بشكل منفصل، وهو ما يستغرق وقتًا أطول ويتطلب المزيد من العمل. أشارت نتائج الدراسة المستقبلية للفريق إلى أن كل مريض في وحدة العناية المركزة (ICU) تم اختباره مصاب ببكتيريا مقاومة للعلاج واحدة على الأقل، في حين أصيبت الأغلبية ببكتيريا مقاومة متعددة في وقت واحد. يأمل العلماء أن تساعد تقنيتهم في منع وإدارة العدوى الشائعة في المستشفيات بشكل أسرع وأكثر فعالية مما كان ممكنًا في السابق. نظرًا لأن مقاومة الأدوية مشكلة واسعة النطاق في المستشفيات وغيرها من الأماكن السريرية، يمكن للنظام تحديد وتتبع وتقليل انتشار البكتيريا الشائعة المقاومة للعلاجات المتعددة في وقت واحد. يمكن أيضًا دمج النهج مع أنظمة المراقبة السريرية الموجودة في المستشفيات. قال الدكتور نيكولاس طومسون، رئيس برنامج علم الطفيليات وعلم الأحياء الدقيقة ورئيس المجموعة في معهد ويلكوم سانجر: “تعد العدوى المقاومة للمضادات الحيوية مشكلة مستمرة في المستشفيات، وبينما يعمل المتخصصون في الرعاية الصحية بجد للحد منها قدر الإمكان، فمن الصعب مكافحة شيء لا يمكنك رؤيته بالكامل. إن دمج التسلسل الجينومي العميق في أنظمة الرعاية الصحية بهذه الطريقة يمنح موظفي المستشفى فرصة جديدة لرؤية هذه البكتيريا وتتبعها، مما يساعد في تشخيص العدوى والسماح بتحديد تفشيها والسيطرة عليها. “إن دمج هذا النهج يمكن أن يساعد في تطوير وتحسين المبادئ التوجيهية لتقييم وإدارة مخاطر العدوى المقاومة للأدوية لجميع مرضى المستشفيات، وخاصة أولئك في وحدات العناية المركزة.” تومسون هو المؤلف المشارك الرئيسي للدراسة التي نشرها الفريق في مجلة The Lancet Microbe، بعنوان “التسلسل العميق لجميع مسببات الأمراض البكتيرية في المستشفيات في إيطاليا في ربيع عام 2020: دراسة مجموعة مستقبلية”. في ورقتهم، خلص الفريق إلى أن “النهج الذي نصفه يمكن أن يسهل تطوير المبادئ التوجيهية المستقبلية لتقييم وإدارة مخاطر العدوى في المستشفيات لمجموعات مختلفة من المرضى، وخاصة في وحدات العناية المركزة.” يكتب المؤلفون أن عدوى المستشفيات الناجمة عن مسببات الأمراض البكتيرية المقاومة للأدوية المتعددة هي سبب رئيسي للوفاة والمرض بين المرضى في المستشفيات. تشكل عدوى المستشفيات خطرًا كبيرًا على المرضى المعرضين للإصابة، وهذا حاد بشكل خاص في وحدات العناية المركزة عندما تكون البكتيريا المرتبطة بالمستشفى متوطنة. وقد يتزايد التهديد في ظل الظروف التي يكون فيها عدد المرضى المصابين بأمراض خطيرة مرتفعًا، كما كانت الحال أثناء جائحة كوفيد-19. وتابع الفريق: “خلال الموجة الأولى من جائحة كوفيد-19، كان زيادة حجم المرضى قيدًا رئيسيًا على فعالية تدابير مكافحة العدوى”. توجد البكتيريا عادة في الجسم أو عليه دون التسبب في ضرر، ولكن إذا دخلت سلالات معينة إلى مجرى الدم بسبب ضعف جهاز المناعة، فقد تسبب التهابات شديدة وتهدد الحياة ما لم يتم علاجها بشكل فعال بالمضادات الحيوية. وكتحدٍ إضافي لمقدمي الرعاية الصحية، فإن بعض هذه البكتيريا مقاومة للمضادات الحيوية. تشكل العدوى التي تسببها البكتيريا المقاومة للمضادات الحيوية مشكلة كبيرة في المستشفيات. يستشهد المؤلفون بأرقام تفيد بأن هذه البكتيريا المقاومة للأدوية من المتوقع أن تسبب وفيات أكثر من السرطان بحلول عام 2050. وفي حين تختبر بعض المستشفيات البكتيريا المقاومة للمضادات الحيوية عند وصولها، لا يوجد نظام يتتبع بشكل فعال جميع البكتيريا المقاومة للأدوية المتعددة في جميع أنحاء المستشفى. على مدى السنوات الخمس عشرة الماضية، أصبحت المراقبة الجينومية أداة قوية لتتبع تطور وانتقال مسببات الأمراض، مما يوفر رؤى حاسمة للمساعدة في إدارة انتشار المرض. ومع ذلك، تتضمن الأساليب الحالية زراعة سلالة واحدة من البكتيريا في عينة في كل مرة، ثم تسلسلها جميعًا بشكل فردي. في دراستهم التي تم الإبلاغ عنها حديثًا، طور الفريق نهجًا يلتقط بيانات تسلسل الجينوم الكامل عبر مسببات الأمراض المتعددة في وقت واحد. يمكن أن يوفر نهج التسلسل العميق لجميع مسببات الأمراض بيانات جينية، بالإضافة إلى تحليلات شاملة على مستوى الجينوم. يمكن للمستشفيات معالجة العينات. التقطت دراسة الباحثين كامل عدد البكتيريا المسببة للأمراض الموجودة في وحدات العناية المركزة المتعددة في المستشفيات والأجنحة العادية خلال الموجة الأولى من جائحة كوفيد-19 في عام 2020. أخذ الفريق عينات من 256 مريضًا في مستشفى إيطالي، والتقط البكتيريا الموجودة في الأمعاء والمجاري الهوائية العلوية والرئتين. يمكن ربط عينات الحمض النووي البالغ عددها 2418 بـ 52 نوعًا من البكتيريا. تتكون ستة وستون بالمائة (2148) من هذه العينات من سلالات مختلفة من أكثر سبع عدوى بكتيرية شيوعًا في المستشفيات. يمكن للباحثين معرفة نوع البكتيريا التي يعاني منها المرضى، بما في ذلك أي مسببات أمراض مقاومة للمضادات الحيوية معروفة موجودة في المستشفيات. وقالوا: “توفر دراستنا أول محاولة لاستعادة سلالات البكتيريا بدقة تعدد أشكال النوكليوتيدات الفردية، حيث تلتقط معظم مسببات الأمراض البكتيرية الرئيسية ذات الصلة السريرية الموجودة في الأمعاء أو مجاري الهواء العلوية أو رئتي المرضى”. وجد الباحثون أن المرضى في وحدات العناية المركزة استعمرتهم بكتيريا واحدة على الأقل لديها القدرة على التسبب في مرض شديد في أي وقت، وأن جينات مقاومة مضادات الميكروبات المهمة سريريًا كانت موجودة في 40 بالمائة منهم على الأقل. قام الفريق برسم خريطة فعالة لانتشار بكتيريا المستشفيات على مدى فترة أخذ العينات لمدة خمسة أسابيع، مما سمح لهم أيضًا بالتنبؤ بالبكتيريا الأكثر احتمالية للظهور في العدوى المكتسبة من المستشفيات. وأشاروا إلى أن “نهج التسلسل العميق المستخدم في الدراسة مكننا من تحديد انتشار مقاومة مضادات الميكروبات وتقدير انتقال العدوى في المستشفيات”. “من خلال أخذ عينات من المرضى في منطقة تأثرت بشدة بكل من جائحة كوفيد-19 والانتشار المتوطن لمسببات الأمراض البكتيرية في المستشفيات، يمكننا أن نرى كيف تنتقل العدوى في بيئة عالية الخطورة. قال المؤلف المشارك جوكا كوراندر، الحاصل على درجة الدكتوراه، من معهد ويلكوم سانجر وجامعة أوسلو: “إن طريقتنا، التي تلتقط المعلومات الجينية عن سلالات بكتيرية متعددة في نفس الوقت، لديها القدرة على تحويل المراقبة الجينومية لمسببات الأمراض، مما يمكننا من التقاط المعلومات الرئيسية بشكل أسرع وأكثر شمولاً من أي وقت مضى دون فقدان الدقة”. وقال المؤلفون: “تعمل الدراسة كدليل على مفهوم كيفية استخدام قوة التسلسل العميق للتحقيق في مسببات الأمراض المتعددة ذات الصلة في وقت واحد بدلاً من النهج المعزول لتسلسل الجينوم الكامل للعزلات الفردية من الأنواع الفردية”. المؤلف الأول هاري ثورب، الحاصل على درجة الدكتوراه، من جامعة أوسلو، هو زميل زائر في معهد ويلكوم سانجر. قال ثورب: “دراستنا هي مثال لكيفية استخدام قوة علم الجينوم لإنشاء صورة كاملة للبكتيريا المقاومة للمضادات الحيوية في وحدات العناية المركزة وأيضًا في أماكن أخرى بالمستشفيات”. “تتطور البكتيريا المقاومة للمضادات الحيوية وتنتشر بسرعة، لذلك تحتاج طرق التتبع لدينا إلى مواكبة هذه التطورات. إن معرفة تسلسل جميع البكتيريا في العينة يعطي صورة أكثر اكتمالاً للتنوع الموجود في منطقة ما، وهو أمر بالغ الأهمية للتنبؤ بالمخاطر وفهم العوامل الخارجية المشاركة في انتشار سلالة معينة”. وأضاف الدكتور فاوستو بالدانتي، مدير وحدة علم الأحياء الدقيقة والفيروسات في مستشفى مؤسسة IRCCS Policlinico San Matteo: “اكتشفت وحدتنا أول حالة إصابة بـ COVID-19 في العالم الغربي، وشهدنا فجر الوباء جنبًا إلى جنب مع الجهود العلمية الضخمة في جميع أنحاء العالم على SARS-CoV-2”. “ومع ذلك، أظهرت الدراسة التي أجراها باحثونا أن البكتيريا المقاومة للأدوية لم تختف. في الواقع، ربما كان التواجد المتزامن للعديد من البكتيريا المقاومة للأدوية في أقسام العناية المركزة التي تستقبل مرضى كوفيد-19 عنصرًا مهمًا في المظاهر السريرية للمرض الجديد في تلك الأيام الدرامية.* الصيدلي إبراهيم علي أبو رمان
طرق التعرف على البكتيريا المقاومة للمضادات الحيوية في المستشفيات
– الدستور نيوز